廣泛代謝組是一種整合了非靶向和靶向代謝物檢測(cè)技術(shù)優(yōu)點(diǎn)的代謝組檢測(cè)技術(shù),利用高靈敏度ABSCIEXQTRAP®6500UPLC-MS/MS液質(zhì)聯(lián)用儀和自建的植物初級(jí)與次級(jí)代謝物數(shù)據(jù)庫(2200多種物質(zhì))、醫(yī)學(xué)代謝物數(shù)據(jù)庫(1500多種物質(zhì)),可實(shí)現(xiàn)高通量、高靈敏、覆蓋廣、定性準(zhǔn)的代謝物檢測(cè)。廣泛靶向代謝組可比較不同樣本間代謝物的種類與豐度差異、篩選出在不同組間具有重要生物學(xué)意義的顯著差異代謝物,并可定性定量檢測(cè)低豐度痕量級(jí)化合物(pM級(jí)別)。
代謝組是指生物體內(nèi)源性代謝物質(zhì)的動(dòng)態(tài)整體。而傳統(tǒng)的代謝概念既包括生物合成,也包括生物分解,因此理論上代謝物應(yīng)包括核酸、蛋白質(zhì)、脂類生物大分子以及其他小分子代謝物質(zhì)。但為了有別于基因組、轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組,代謝組之前只涉及相對(duì)分子質(zhì)量約小于1000的小分子代謝物質(zhì),現(xiàn)在以上幾種物質(zhì)均有囊括。
基于功能通路的關(guān)聯(lián)分析策略:
該分析主要基于“參與同一生物過程中的基因或代謝物具有相同或相似的變化規(guī)律”。以相同生物學(xué)意義為基礎(chǔ),通過代謝組數(shù)據(jù)獲得重要差異代謝物或重要代謝通路,聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)鑒定出重要代謝通路上發(fā)生變化的目標(biāo)基因?;蛘邚霓D(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)入手,經(jīng)過差異分析獲取大量差異基因,再結(jié)合代謝組數(shù)據(jù),快速鑒定代謝相關(guān)的差異功能基因。多環(huán)芳烴是一種廣泛存在的持久性環(huán)境污染物,可在植物的不同發(fā)育階段發(fā)揮毒性。植物對(duì)多環(huán)芳烴的防御機(jī)制知之甚少
廣泛代謝組應(yīng)用領(lǐng)域:
1、脅迫應(yīng)答機(jī)理研究;
2、藥用植物藥用成分合成機(jī)理及藥物代謝研究;
3、蔬果花卉顏色改良育種;
4、動(dòng)植物生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)理研究;
5、疾病biomarker篩選;
6、疾病發(fā)生發(fā)展機(jī)制研究;
7、藥效與毒副作用研究。