1) 總RNA提取
2) 已知序列的驗(yàn)證:根據(jù)客戶提供的已知序列設(shè)計(jì)引物,以總RNA為模板進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,驗(yàn)證參考序列的存在及方向。
3) 5’和3’RACE
a) RNA的去磷酸化處理
b) RNA的3’末端處理;RNA的5’末端處理
c) cDNA的合成
d) 5’和3’RACE的PCR反應(yīng)
e) PCR產(chǎn)物構(gòu)建TA克隆
f) 分別隨機(jī)挑取10個(gè)克隆進(jìn)行測(cè)序
4) 對(duì)獲取的序列進(jìn)行驗(yàn)證以驗(yàn)證獲取的5' RACE或3' RACE序列與已知序列是否連續(xù)存在于同一條cDNA片段上。
客戶提供
總RNA量大于10 mg,如果基因的豐度較低或者未知序列較長(zhǎng),請(qǐng)?zhí)峁┍M量多的實(shí)驗(yàn)材料。
已知的參考序列長(zhǎng)度≥200 bp。
我們提供
構(gòu)建好5’和3’RACE的TA克隆(含20%甘油的LB培養(yǎng)基),裝到PMD18-T載體上;測(cè)序圖譜;實(shí)驗(yàn)報(bào)告
質(zhì)量保證
獲取的5' RACE或3' RACE序列與已知序列連續(xù)存在于同一條cDNA片段上